一张850个SSR座位的大豆遗传重组连锁图的构建

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作 者
木金贵; 宛煜嵩; 吕蓓; 王珍; 张丽霞; 巩鹏涛; 赵金荣; 杜维广; 刘学义; 方宣钧
作者单位
海南省热带农业资源开发利用研究所; 海南省热带农业资源开发利用研究所; 海南省热带农业资源开发利用研究所; 海南省热带农业资源开发利用研究所; 海南省热带农业资源开发利用研究所; 海南省热带农业资源开发利用研究所; 海南省热带农业资源开发利用研究所; 黑龙江省农业科学院大豆研究所; 山西省农科院经济作物研究所; 海南省热带农业资源开发利用研究所
关键词
遗传重组连锁图  作图群体  
论文摘要
大豆分子遗传连锁图是大豆分子遗传学研究的重要内容,也是开展大豆基因组研究的重要平台。高密度分子遗传连锁图能有效地应用于复杂性状的基因定位、图位法克隆基因、比较基因组学研究以及分子标记辅助育种。对大豆这样十分重要的经济作物来说,构建高密度的分子遗传连锁图谱,SSR 标记无论在理论上还是在实际应用中均具有独特的优点。大豆是一个复杂基因组,要构建一张理想的遗传连锁图,并非一个作图群体,某一种标记就可以完成的,而是需要来源于不同遗传背景的多个群体、多种类型的遗传标记配合,才能获得“理想的”遗传图谱。但是从众多的分子标记来看,SSR 标记在理论上还是在应用领域均具有独特的有点。我们试图构建一张SSR 标记饱和的大豆遗传连锁整合图谱,以期该图谱具有非常好的实用价值,成为大豆图位法克隆(Map basedcloning)和图谱法育种(Map based breeding)的技术平台。本研究以刘学义研究员课题组与方宣钧研究员课题组共同构建的含有474个家系得F_1O 代大豆重组自交系Jinf(晋豆23×灰布支黑豆)作为基础作图群体(刘学义等,2003),以方宣钧博士课题组和杜维广研究员课题组合作培育的栽培豆×野生豆(G.max×G.soja),栽培豆×半野生豆(G.max×G.gracilis),栽培豆×农家豆(G.max×G.max)三个均超过1000个家系的作图群体作为用于进一步饱和为目的的辅助群体,绘制成一张含有850个SSR 座位的大豆遗传连锁图,初步估算总遗传图距为3000~3500cM,相邻标记间的平均距离为3.5~4.0cM,标记间最大距离小于15 cM,各个连锁群没有断点(gap),整合成20个连锁群,对应于大豆(Glycine)20条染色体(吕蓓等,2005;宛煜嵩等,2005)。
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